故事讲述了大雄和哆啦A梦一起使用时光机器来到未来的宇宙，发现那里正在进行一场小规模的星际战争。大雄和哆啦A梦被卷入其中，被误认为是来自敌对势力的间谍。
在宇宙中，他们遇到了各种各样的外星人，有些友好，有些敌对。大雄和哆啦A梦不仅要努力躲避敌人的追捕，还要想办法证明自己的清白，并帮助解决宇宙之间的纷争。
经过一系列的冒险和挑战，大雄和哆啦A梦最终成功揭露了真正的间谍，阻止了一场大规模的宇宙战争爆发。他们的勇敢和智慧得到了外星人的认可和感激，成为了宇宙中的英雄。
回到地球后，大雄和哆啦A梦回顾这次宇宙之旅，感慨万千。他们深知和平的珍贵，也明白了团结合作的重要性。从此，他们更加珍惜现在的生活，愿意为守护和平而努力奋斗。